Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHAMP1Q96JM3 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHAMP1Q96JM3 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms