Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ETFRF1Q6IPR1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms