Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms