Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP2C1P98194 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms