Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TBC1D27-201ENST00000261651 4838 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SH3BGRP55822 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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