Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD1P28340 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD1P28340 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD1P28340 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms