Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL138847.2-201ENST00000624477 1819 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 RABGAP1-213ENST00000616002 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN16-201ENST00000316737 1040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 OR52E4-201ENST00000316987 1027 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL662789.1-201ENST00000448198 724 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC002463.1-201ENST00000453459 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 MTHFD2P1-202ENST00000489784 871 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 TP53-201ENST00000269305 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 TP53-226ENST00000620739 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SHANK2-AS3-201ENST00000307548 1683 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms