Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB8P9-201ENST00000422534 1276 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB8P10-201ENST00000430210 1279 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL16P-201ENST00000476316 269 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms