Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP2BPQ9P2M1 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms