Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP4P49662 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CASP4P49662 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms