Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK8P49336 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK8P49336 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK8P49336 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK8P49336 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK8P49336 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK8P49336 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK8P49336 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms