Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms