Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF1P21675 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TAF1P21675 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms