Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RLBP1P12271 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms