Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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