Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC044798.2-201ENST00000564222 1235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC010904.2-201ENST00000606959 634 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC110741.3-201ENST00000611983 659 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CBR3-AS1-214ENST00000624080 822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 LINC01992-201ENST00000567574 1340 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATXN8OSP0DMR3 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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ATXN8OSP0DMR3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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