Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC12Q8WUD4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms