Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms