Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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