Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NPRL3Q12980 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms