Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 TAC3-209ENST00000458521 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SULT1A3-202ENST00000395138 1326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 RN7SKP195-201ENST00000516587 303 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMARCA4P51532 AL139353.1-202ENST00000547378 474 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms