Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC023157.1-201ENST00000453713 402 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC145285.1-201ENST00000469929 694 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AP3M2-205ENST00000517922 1094 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 LIPC-204ENST00000433326 1484 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI3P10071 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 HSD3B2-206ENST00000543831 1783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ROPN1B-201ENST00000251776 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC006967.2-201ENST00000426169 432 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SPTY2D1-AS1-202ENST00000511927 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CNOT4-204ENST00000414802 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI3P10071 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GLI3P10071 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GLI3P10071 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GLI3P10071 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GLI3P10071 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GLI3P10071 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GLI3P10071 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms