Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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TMEM225BP0DP42 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TMEM225BP0DP42 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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