Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PRM2P04554 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PRM2P04554 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PRM2P04554 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PRM2P04554 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PRM2P04554 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PRM2P04554 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PRM2P04554 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PRM2P04554 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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