Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9Y3F1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9Y3F1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms