Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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PPARGC1AQ9UBK2 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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