Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms