Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UBE2E2Q96LR5 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms