Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDLIM3Q53GG5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDLIM3Q53GG5 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDLIM3Q53GG5 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDLIM3Q53GG5 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDLIM3Q53GG5 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDLIM3Q53GG5 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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PDLIM3Q53GG5 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDLIM3Q53GG5 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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