Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PDCD1Q15116 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PDCD1Q15116 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PDCD1Q15116 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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PDCD1Q15116 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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