Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HADHBP55084 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms