Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1P21675 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1P21675 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1P21675 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF1P21675 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 FRG2EP-201ENST00000634243 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF1P21675 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF1P21675 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1P21675 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF1P21675 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms