Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RRBP1Q9P2E9 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RRBP1Q9P2E9 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms