Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYNGAP1Q96PV0 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms