Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 STT3A-211ENST00000529196 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MRPL55-207ENST00000366733 834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 H1FOO-202ENST00000503977 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms