Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD2Q16342 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDCD2Q16342 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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