Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PDCD1Q15116 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PDCD1Q15116 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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