Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PMS2P11Q13670 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms