Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CRB1P82279 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CRB1P82279 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRB1P82279 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRB1P82279 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms