Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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