Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK8P49336 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK8P49336 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK8P49336 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK8P49336 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK8P49336 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms