Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NESP48681 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NESP48681 GSTA4-201ENST00000370959 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 ZBED3-AS1-206ENST00000508401 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AC091132.3-201ENST00000579701 470 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AC138645.1-201ENST00000582765 470 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 LYPD4-202ENST00000601246 1076 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 LINC02381-202ENST00000635070 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NESP48681 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 HAMP-201ENST00000222304 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 HNRNPA1P69-201ENST00000552536 933 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NESP48681 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 AL591368.1-201ENST00000437181 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 AP001775.1-201ENST00000532608 586 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NESP48681 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms