Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC007255.1-202ENST00000447171 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC022392.1-201ENST00000609403 744 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PIN1P1-202ENST00000439639 301 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 HINT1-208ENST00000513012 583 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL356423.1-201ENST00000604953 538 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 DLG2-AS1_2.1-201ENST00000614607 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TCTE1-201ENST00000371504 616 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 BX284656.1-201ENST00000446364 668 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 HLA-DRB9-201ENST00000449413 343 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AL031773.1-201ENST00000453579 554 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC091057.1-201ENST00000501830 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 RPL37A-212ENST00000600880 425 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 TTC28-AS1_1.1-201ENST00000614690 162 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRMP28827 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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