Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
HMGB1P1B2RPK0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms