Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC26-207ENST00000478836 1794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms