Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms