Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLKQ9UBT6 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLKQ9UBT6 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms