Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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