Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IRX2Q9BZI1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms