Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLF1Q9BQI6 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms